农业生产与我国粮食安全密切相关，一方面，水污染问题会产生大量的酸性污水，这些腐蚀性的污水在农机工作过程中附着在各种管道或重要部件上，很容易造成管道和设备的腐蚀，从而降低机械的使用寿命，加重了农业生产在设备维护和更新上的支出。另一方面，水中污染物质种类丰富，会对土壤特性及作物的成长造成严重的影响，有的会改变该地区的土壤性质，降低土壤功能，水中污染物浓度过高的时候，有可能直接杀死农作物，且有可能被农作物吸收，进而使作物产生毒性，危害人类健康。另外，土壤中微生物的大量活动也会严重影响农作物的发育和生长。

生活污水、畜禽饲养场污水以及制革、洗毛、屠宰业和医院等排出的废水，常含有各种病原体，如病毒、病菌、寄生虫。水体受到病原体的污染会传播疾病，如血吸虫病、霍乱、伤寒、痢疾、病毒性肝炎等。流行的瘟疫，有的就是水媒型传染病。如1848年和1854年英国两次霍乱流行，死亡万余人；1892年德国汉堡霍乱流行，死亡750余人，均是水污染引起的。污水处理受病原体污染后的水体，微生物激增，其中许多是致病菌、病虫卵和病毒，它们往往与其他细菌和大肠杆菌共存，所以通常规定用细菌总数和大肠杆菌指数及菌值数为病原体污染的直接指标。

随着我国国民经济的迅速发展，各大工业企业和工厂的排污量和用水量日趋增加，由于再用水、排水、污水处理等各个环节的疏漏，会带来严重的水污染和水环境的恶化，进而影响到生态环境的平衡。水污染问题带来的一系列影响对人类健康安全和工农业生产都是极为不利的，当务之急是需要政府、企业和公众团结起来防治水污染，防止水污染问题恶化。