发酵秸秆就是通过微生物菌来处理软化秸秆，然后使用发酵好的秸秆长期保存，作为喂养牛羊的饲料。发酵秸秆饲料的原理是通过有效微生物的生长繁殖使分泌酸大量增加，秸秆中的木聚糖链和木质素聚合物酯链被酶解，促使秸秆软化，体积膨胀，木质纤维素转化成糖类。连续重复发酵又使糖类二次转化成乳酸和挥发性脂肪酸，使pH值降低到4.5~5.0，抑制了腐败菌和其他有害菌类的繁殖，达到秸秆保鲜的目的。其中所含淀粉、蛋白质和纤维素等有机物降解为单糖、双糖、氨基酸及微量元素等，促使饲料变软、变香而更加适口。最终使那些不易被动物吸收利用的粗纤维转化成能被动物吸收的营养物质，提高了动物对粗纤维的消化、吸收和利用率。
功效功能
青贮转化率高达95%，精粮节约10%左右。每进食1吨青贮料奶牛多产奶140公斤、肉牛多增加体重4公斤(较不加产品的青贮相比)。黄贮可显著增加秸秆饲料的营养成份：粗蛋白11%—14%、有机酸提高10倍以上、维生素B族含量提高几十倍；纤维素酶以及各类消化酶的增加使秸秆利用率高达80%以上，每进食1吨黄贮料奶牛多产奶200公斤以上，肉牛多增加体重6公斤以上(较不加产品的常规饲喂)。促进肉质、奶质改善。乳脂率增加5%—10%，蛋白质含量提高3%—8%，脂肪降低5%—10%，胆固醇含量降低15%—40%，符合绿色食品标准，有较强的市场竞争力。
1、缩短秸秆饲料青贮、黄贮成熟时间，提高饲料存贮质量。
2、改善饲料适口性，饲料质地柔软，有醇香、酸香、果香味，采食量提高20%—40%，采食速度提高20%以上。动物对其中的微生物菌体蛋白氨基酸、乳酸菌、酵母菌就象人饮用的氨基酸口服液、酸奶和啤酒中的成份一样养成一种嗜好，喜爱采食。
3、显著增加饲料营养成份，增加了秸秆的柔软性和膨胀度，使瘤胃微生物能直接地与纤维素接触，提高了秸秆的消化率。牛、羊饲喂微贮饲料，可提高牛、羊瘤胃微生物区系纤维素酶的解脂酶活性，能促进挥发性脂肪酸的生成，挥发性脂肪酸可为微生物菌体蛋白的合成提供碳架，而丙酸系反刍家畜重要葡萄前体。
4、提高饲料消化吸收利用率，提高生产性能，含有多种有益微生物活菌，建立动物肠道内微生态平衡，动物对其中的饲料营养成份完全吸收利用，可使蛋白质、能量、矿物质的利用率达95%，极大提高粗纤维饲料(秸秆、谷壳粉、统糠)吸收利用率，因此可降低饲料成本，长期使用能节省10-25%饲料。
5、提高免疫力，预防并治疗肠道疾病，建立肠道微生态平衡，抑制有害病菌的繁殖，增加有益微生物繁殖。
6、除臭驱蝇，减少污染，控制细菌性疾病，能减少粪便中氮、磷、钙的排泄量，减少粪便臭味及有害气体排放，表现为动物粪便臭味逐步减轻，减少饲料蛋白质分解为氨气浪费，空气中氨浓度下降到26.5PPM，臭气强度降到2.5级以下，大肠杆菌、沙门氏杆菌浓度得到有效控制，减少疾病发生率，促进健康生长。
7、改善肉奶品质，用微生物活菌制剂代替抗生素生产“绿色肉”、“无抗奶”。
发酵方法
1、发酵原料各种农作物秸秆、树叶杂草、瓜藤、水果渣、干蔗渣、谷壳粉、统糠、食用菌渣、鸡粪等废弃物。
2、菌种用量青贮：0.0125%，黄贮：0.025%；即250克活菌制剂做2吨青贮或者1吨黄贮。
3、菌液配制
(1)菌种活化：根据秸秆总量计算所需菌种数量，然后用5倍的温水(水温在30度左右，有条件加入少许白糖)进行2-6小时的复活。
(2)菌液配制：将复活的菌液加入水中，搅匀备用。水的用量为：秸秆含水在60%－70%，每吨秸秆补水5公斤左右，秸秆含水量40%上下，每吨补水400公斤左右，秸秆含水量20%上下(黄贮)，每吨补水1000公斤左右。(黄贮1吨麦杆、稻杆：食盐10公斤，补水1300公斤；黄贮1吨玉米秸：食盐7公斤，补水900公斤)
4、装窖
(1)分层计算：按每层厚度30厘米计算一窖分几层，再预测每层秸秆重量，由此分配每层所需菌液数量。(每层秸秆重量＝干秸秆比重×窖内面积×每层压实的厚度。玉米秸秆比重：110公斤/立方米，麦秸秆比重：100公斤/立方米)
(2)分层装窖：装铡碎的秸秆按每层30厘米的厚度进行装窖。如果黄贮秸秆，那么在每层上面加入该层秸秆重量0.5%的玉米面或麸皮粉。秸秆长度2－5厘米。
(3)分层喷洒菌液：小窖用喷壶瓢洒，大窖用小水泵喷洒。
(4)分层压实：规模小人工踩实，规模大用拖拉机轧实。
5、封窖、发酵
装到高出窖平口0.4－0.5米为止。窖顶呈馒头形，并在最上面按250克/平方米均匀地撒一层细食盐，然后用塑料膜密封，上面可加保温措施。在常温下7－10天即可开窖使用。(冬天发酵时间可延长)
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