依据台湾儿童癌症基金会多年的统计，在所有的儿童癌症中，十大常见的儿童癌症按照发生机率的高低，依序为：
（１）白血病
（２）脑瘤
（３）恶性淋巴瘤
（４）神经母细胞瘤
（５）生殖细胞肿瘤
（６）恶性骨肉瘤
（７）软组织恶性肿瘤
（８）威尔姆氏肿瘤
（９）恶性肝肿瘤
（１０）视网膜母细胞瘤
这些肿瘤与外国的儿童癌症的发生情况类似。在治疗的选择上，除了手术、化疗之外，约有３成的病童必须接受放射治疗，尤其是软组织肉瘤及脑部肿瘤的治疗。儿童脑瘤占所有儿童癌症患者的２０％左右，是儿童最常见的实体肿瘤，在台湾，每年新确诊病例约有一百多例。放射治疗在小儿脑瘤的治疗上扮演了重要的角色，但是因为普通放射治疗使用的高能量Ｘ光，一旦进入人体，无法随意在肿瘤区停住，为了让治疗所需的高剂量高能Ｘ光可以集中在肿瘤区域内，付出的代价是让大范围的正常脑部组织，在治疗过程中暴露在辐射内。质子治疗则不同，是利用调控布拉格峰的位置，质子射束一旦进入人体，就可以在穿透肿瘤区后停住，避免伤害位于肿瘤区后方的正常组织。
正常组织被照射的剂量和范围大小，与放射治疗的后遗症有关。这些负面的影响，是接受放射治疗后的儿童需要长期面对的。放射治疗后的长期后遗症，通常包括神经功能（视力、听力等）、内分泌、认知和记忆功能上的缺失，以及继发性恶性肿瘤。这些治疗后的副作用，对于长期存活的儿癌病童，会造成身体功能损伤以及生活质量的下降。质子治疗比起普通放射治疗，可以减少副作用发生的风险及严重度。
虽然质子治疗对于年纪小的病童是比较好的放射治疗选项，但质子治疗目前仍属于自费治疗的项目，有部分的病童家庭经济能力不足以负担。长庚纪念医院为落实社会公益精神，针对儿童癌症需接受质子放射治疗之经济弱势个案，特别提供质子治疗费用补助，希望减少小朋友长期副作用的发生，亦帮助其降低家庭的经济负担与压力。统计自２０１５年１１月至２０１８年６月间，共计补助１５位、补助金额达８３０万元。长庚纪念医院强调，儿童是国家未来的主人翁，在少子化的现今，让每个儿童都能健康快乐的成长，是我们共同的希望与积极努力的方向。
