聚酯TPU软质热塑性聚氨酯与潮湿的土壤长时间接触，会被微生物侵蚀，而聚醚TPU软质或硬质热塑性聚酯以及聚醚热塑性聚氨酯或硬质热塑性聚氨酯通常不会受到微生物侵蚀。
聚酯TPU热塑性聚氨酯用碳化二亚胺进行保护后，耐水解性有所提高。聚醚酯型热塑性聚氨酯和聚酯TPU热塑性聚氨酯在高温下的耐水解性最好。
聚酯易受水分子的侵袭而发生断裂，且水解生成的酸又能催化聚酯的进一步水解。聚酯TPU种类对弹性体的物理性能及耐水性能有一定的影响。随聚酯二醇原料中亚甲基数目的增加，制得的聚酯TPU聚氨酯弹性体的耐水性提高。酯基含量较小，其耐水性也较好。同样，采用长链二元酸合成的聚酯，制得的聚氨酯弹性体的耐水性比短链二元酸的聚酯型聚氨酯好。
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